Toksisitas boron (B) menghambat pembentukan pati dari gula dan mempengaruhi pembentukan kompleks B-karbohidrat. Toksisitas boron adalah kondisi langka yang biasanya terjadi pada musim kemarau ketika kandungan B dalam air tanah tinggi. Ini bisa disebabkan oleh

• konsentrasi B yang besar dalam larutan tanah karena penggunaan air tanah yang kaya B dan suhu tinggi (misalnya, di daerah kering, sumur tabung yang sangat dalam, atau sumur di daerah yang terkena aktivitas panas bumi)
• konsentrasi B yang besar dalam larutan tanah karena bahan induk kaya B. Kandungan B tinggi di beberapa sedimen laut, batuan plutonik, dan bahan vulkanik lainnya (misalnya, tufa), tetapi kandungan di batuan beku rendah, dan
• kelebihan boraks atau aplikasi besar limbah kota (kompos).

Toksisitas B paling umum terjadi di daerah kering dan semikering, tetapi juga telah dilaporkan pada padi di daerah lain. Tanah yang rentan terhadap toksisitas B termasuk jenis berikut:

• tanah yang terbentuk dari bahan induk vulkanik, biasanya berhubungan dengan penggunaan air irigasi yang dipompa dari sumur-sumur dalam yang mengandung konsentrasi B yang besar (misalnya, pertanian IRRI, Los Baños, dan Albay, Filipina)
• beberapa tanah salin pantai